Современная биология и медицина всё чаще полагаются на секвенирование РНК для изучения внутреннего состояния клеток. Этот метод позволяет расшифровывать все молекулы, транскрибированные с ДНК. Поскольку состав и количество этих молекул различаются у разных типов клеток, их анализ помогает выявлять, например, конкретные разновидности иммунных клеток — что особенно важно при диагностике заболеваний и установлении причин патологий.
Проблемы обработки данных в РНК-секвенировании
Несмотря на высокую точность современных устройств для секвенирования, последующая обработка полученных данных остаётся сложной задачей. Ручная обработка занимает много времени, а автоматизированные алгоритмы часто допускают ошибки, особенно при анализе редких или необычных клеток, таких как те, что встречаются в редких опухолях. Эти ограничения замедляют внедрение метода в клиническую практику.
Новый ИИ-инструмент для анализа клеток
Группа учёных из МГУ, Национального исследовательского центра эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи и ФМБА разработала программу scParadise, основанную на системах искусственного интеллекта. Она способна с точностью до 99,9% различать различные клеточные типы по их РНК-последовательностям и оценивать белковый профиль каждой клетки.
Открытие новых клеточных типов
Авторы использовали scParadise для анализа жировой ткани у здоровых людей и пациентов с ожирением. Инструмент не только подтвердил наличие всех известных клеточных форм, но и выявил три ранее неописанные разновидности иммунных клеток. Эти клетки могут играть ключевую роль в развитии хронического воспаления, характерного для ожирения.
Перспективы применения в медицине
По мнению исследователей, новый алгоритм открывает широкие возможности для клинической диагностики. С его помощью можно будет точно определить причины воспалительных процессов в тканях у пациентов с ожирением, а также находить единичные клетки в опухолях, устойчивые к химиотерапии. Такой подход позволит персонализировать лечение, повысить его эффективность и минимизировать побочные эффекты.
Оставить комментарий